Профессиональный опыт: Нью-йоркское отделении юридической фирмы Cleary, Gottlieb, Steen & Hamilton, с в 2001 года перевелся в московский офис фирмы. В 2004 году начал работать в юридическом отделе «Ренессанс Капитал» в качестве вице-президента, а в 2006 году стал исполнительным директором и возглавил отдел. В сферу его компетенции входили вопросы, связанные с рынками акционерного капитала, управлением активами, инвестиционной банковской деятельностью, акционерным финансированием и управлением по работе с долговыми обязательствами. Евгений занимался правовыми вопросами, связанными со всеми видами ценных бумаг, инвестиционно-банковскими услугами и структурными финансовыми сделками, в которых участвовал «Ренессанс Капитал».
В 2008 году присоединился к московскому офису ведущей международной юридической фирмы Herbert Smith Freehills в качестве партнера. В настоящий момент возглавляет практику рынков капитала и практику частных прямых инвестиций в России. Международные юридические справочники IFLR 1000, Chambers Global, Chambers Europe и Best Lawyers из года в год включают Евгения Зеленского в число лучших юристов, консультирующих по корпоративному праву и правовому сопровождению сделок на рынках капитала и сделок слияний и поглощений в России.
В составе Совета Фонда «АГАТ» с июля 2009 года. С октября 2021 года - Председатель Совета.